在PHP开发中，面对iOS应用的接口调用，Web安全问题尤为关键。注入攻击是常见的安全隐患，尤其在处理用户输入时需格外谨慎。

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使用预处理语句（Prepared Statements）是防范SQL注入的有效手段。PHP中的PDO或MySQLi扩展支持这一功能，通过参数化查询可有效隔离用户输入与SQL逻辑。

对于非数据库操作的输入，如GET或POST参数，应进行严格的过滤和验证。例如，使用filter_var函数对邮箱、URL等进行格式校验，避免非法数据进入系统。

在iOS端，开发者也需配合做好输入校验，防止恶意构造的请求发送到服务器。同时，建议采用HTTPS协议，确保数据传输过程中的安全性。

除了输入处理，输出编码同样重要。PHP中使用htmlspecialchars等函数可以防止XSS攻击，特别是在将用户输入显示到页面时。

定期更新依赖库和框架，修复已知漏洞，是提升整体安全性的基础措施。同时，设置合理的错误信息，避免暴露敏感细节。

综合来看，PHP与iOS协作开发中，需从前后端双向入手，构建多层次的安全防护体系，以应对不断变化的网络威胁。